Alle attività liturgiche che sono comuni a tutte le parrocchie e le chiese, il nostro Santuario è punto di riferimento per i fedeli della città e dei paesi limitrofi in particolare nel corso della Quaresima e della Settimana Santa.

Evento particolare che si esprime con la devota preghiera di ringraziamento al Ss. Crocifisso è la Giornata della Riconoscenza che vuole perpetuare nel tempo il ricordo della protezione del Crocifisso sui comaschi e sulla città ricevuta nel corso della guerra.